HONDA在1990年推出了MC21。在前篇提过，虽然1988年式的MC18型就已经具有最强NSR的车款印象，不过在业界一般认为撇除趣味、嗜好不谈，MC21才是历代最好的NSR，甚至连HONDA的研发者也几乎认同“MC21就是NSR的完整版”。
MC21型（1990〜93年式）
▲NSR250R MC21型
MC21型有以下特色:
（1）采用へ字型的海鸥式摇臂
（2）后轮稍微缩小为17寸（到MC18为止的后轮是18寸）
（3）采用双灯泡的长方形头灯
（4）车架形状变更
之所以把MC21称为历代NSR完整版的原因在于，对骑士而言较不容易转弯的MC18来说，MC21具有高度的转弯性能。由于MC21的车架刚性非常高且拥有适度的柔韧性，加上后轮稍微缩小成17寸，摇身一变成为“任何人骑乘都能够轻松转弯”的车体结构。
不只如此，MC21也提升了引擎的潜在能力，并采用海鸥式摇臂，也增加膨胀室（chamber）运用的自由度，PGM装置(一项由电子控制点火时机、化油器、RC阀、机油帮浦等作动的装置，这也正是让NSR成为最快车款、同时也可以说是最核心的装置)也进化到第3代。
如果把MC21的解限速装置拆下、放上马力测试机的话，能够发挥和1988年式相同的57〜58ps的马力，达到马力峰值过后的动力流失情况也不明显。也就是说，MC21同时具备1988年式的动力与1989年式的好操控性。
辨别MC18和MC21的方法
由于调整了整体的刚性平衡，所以MC21的车架完全不同。从主车架的粗细马上就能瞭解MC18和MC21的差异。相较于采用粗管材质做为主车架的MC18，MC21的主车架看起来相当细薄。
如同先前提到的，MC21车架的横向刚性比MC18低，也因此在转弯时能够达到适度的扭转刚性平衡；反之则是增加主车架的上下高度，以维持刹车时必要的纵向刚性结构。
▲虽然主车架的宽度变窄，但是却加大车架整体的宽度，并且调整后摇臂轴芯附近的设计，达成连同细节在内都顾及的整体刚性平衡。
可以说是集结了历代NSR优点的MC21，同时也是历代NSR车款中，首度没有每年进行改款的车款，到1993年为止的4年期间持续推出（期间有极为细微的规格变更）。虽然当时正值仿赛车款热潮下滑的时期，不过MC21的生产台数仍旧约有4万3000台，目前在日本的登记使用台数也有1万2000台左右，因此不论现在还是过往，MC21都是NSR台数最多的车款。
MC28型（1994〜99年式）
▲NSR250R MC28型
NSR的最终款正是第5代的MC28，MC28推出时正值热门车款转变成街车车款的时代。而MC28的特点在于，虽然骑乘性能几乎承袭了MC21，不过也投入了各种全新的未来技术。
MC28不同于MC21的主要变更点如下：
（1）采用单摇臂“Pro-Arm”
（2）使用PGM卡式钥匙系统
（3）新型前叉及刹车卡钳
（4）改良外型的油箱及前/后车身整流罩
（5）采用数位式时速表（转速表仍为指针式）
首先，MC28的最大特色正是单摇臂“Pro-Arm”，这是VFR400R（NC24／30）和VFR750R（RC30）等车款已经采用的结构。也因为具有绝佳的帅气外型，因此MC21以前的NSR改装单摇臂已经是车主必备的改装手法。
不过，会有如此改变，其实背后有着MC21的海鸥式摇臂与YAMAHA的专利相抵触，所以不得不变更摇臂的秘辛……。
此外，MC28也采用世界首创的卡式钥匙系统，这是以电磁卡式钥匙取代一般钥匙的新技术。卡式钥匙具有改变点火时机等控制引擎的功能，所以如果使用HRC贩售的竞赛用卡式钥匙的话，轻松就能够提升引擎性能。例如，MC21之前的解限速都必须经由改装达成，而MC28只要把HRC的卡式钥匙插入就可以了（由于HRC卡式钥匙设计专为封闭赛道使用，所以使用HRC钥匙时的时速表就不会动，也无法在一般道路上骑乘）。
奢侈地投入以上这些未来技术的MC28，却因为自主规范的缘故，将输出马力从45ps减少至40ps，变速箱整体的齿比也缩短，最高时速也限定在180km/h左右。
这也就是说，如果想要把MC28改装成如同MC21规格的话，就必须要对口径较小的膨胀室进行加工（一般是更换成改装用膨胀室），变速箱也要更换成MC21用的规格、点火类配备也要进行细微的调整（最理想的做法是直接使用HRC卡式钥匙）……等等，必须进行许多改装调整，所以在MC28自主规制的枷锁下，造成想要提高潜在性能就得多花费一些工夫。
▲MC28的卡式钥匙。把卡式钥匙插入仪表板下的插槽就能启动车子；油箱盖则要利用内藏在卡式钥匙里的一般钥匙进行开关（卡式钥匙左上的三角部分）。
话虽如此，挟着Rothmans（1994年式SP）和Repsol（1996年式SP）的人气涂装，以及单摇臂的帅气设计，依旧有许多车迷争相模仿，加上配备新款的化油器、PGM装置也进化到第4代等，使得引擎变得更好操控。
另外，缩短25mm的油箱、加宽的坐垫以及稍微往前调的脚踏等，打造出舒适的骑乘姿势，前侧煞车卡钳也采用新设计…等，连细部装备都达到成熟完备及高级化，因此MC28可以说是与最终款一名相符的NSR。
由于MC28是在仿赛车款热潮后登场的车款，因此生产台数也设定在略少的6000台，不过从目前在日本仍有5000多台登记使用的现况来说，不难看出MC28的车主们相当珍视MC28的倾向。
▲NSR的两大人气赞助商涂装-Rothmans和Repsol，这也是MC28的特色之一。尤其是Repsol涂装版，采用的是和近年以橘色为主色不同的蓝色主色（Honda的正式名称为Helles亮泽蓝）十分美形，堪称是历代NSR中最具质感的涂装。
辨别MC21和MC28的方法
那么，如同前面提到的，改装MC28的单摇臂是其他NSR车型的招牌改装手法，那么如果把车架的基本结构几乎和MC28相同的MC21 进行单摇臂化的话，就会变得和MC28无法区别了吗?其实，这个时候的辨别方法和MC18一様，请看看后摇臂轴芯周边。
▲仔细看箭头的部分！
如果试着比较MC21和MC28的车尾整流罩，就能发现MC21的车尾整流罩前端没有碰到车架，能够稍微看到座垫后扶手；相较之下，MC28的整流罩前端彷佛沿着车架般延伸，完全覆盖住座垫后扶手，也为了固定这个加长的车尾整流罩，MC28的车架上特别增设了安装的螺丝孔。
▲为了收纳龙头锁结构，在车架前管内侧开孔的MC28车架。
此外，由于MC28采用的是卡式钥匙，所以没有钥匙锁头，因此车架的前管内侧开了一个大孔，并把电磁式龙头锁装置收纳在此处。从外表来看虽然看不到，不过这也是MC21与MC28车架最大的差异之一。